Когда Гарри и Гермиона танцуют, по радио звучит песня 'O Children' в исполнении Ник Кейва и The Bad Seeds. Однако эта песня была написана в 2004 году, тогда как действие фильма происходит в 1997 году.
На протяжении книг и фильмов персонажи Гарри Поттера для письма используют исключительно перья. Однако, когда Ксенофилиус Лавгуд рисует символ Даров Смерти, он неоднократно говорит: «Мне нужно взять ручку». Он несколько раз произносит слово «ручка», а затем приступает к рисованию символа. Хотя трудно разглядеть, каким инструментом он рисует, ясно, что он явно не использует перо.
(примерно на 1 ч. 35 мин.) Когда Гарри собирается прыгнуть в озеро за мечом Гриффиндора, он погружается в воду в очках. Они видны, пока он тонет. После возвращения на поверхность всё размыто, и очки у него уже не надеты. Гарри поднимает их со льда в месте, совсем не рядом с прорубью, через которую он нырял.
(примерно на 37-й минуте) Когда официантка в кофейне подходит, чтобы принять заказ у Гарри, Рона и Гермионы, она дважды проходит по одному и тому же участку.
(примерно на 1 ч. 50 мин.) Лист бумаги, на котором Ксенофилиус Лавгуд рисует символ Даров Смерти, меняется между кадрами. Когда он рисует символы, на бумаге виден размазанный след, но когда камера отъезжает и он разговаривает с Гарри, на бумаге нет никакого пятна.
(примерно на 48-й минуте) Когда Гермиона произносит «Экспеллиармус» в сторону Мандунгуса Флетчера и забирает у него палочку (в Гриммольд-плейсе), она и Гарри, кажется, мгновенно устремляются прямо вперёд, что явно не является аппарацией.
СПОЙЛЕР: В книге, когда Снейп приносит меч, он смог найти Гарри и обойти меры безопасности только потому, что Гермиона вынесла из дома Сириуса портрет директора Финеаса Нигеллуса Блэка, и Блэк, находясь в своём официальном портрете в Хогвартсе, рассказал Снейпу, как их отыскать. В фильме портрет вообще не выносили и с ним никак не взаимодействовали.
(примерно на отметке 1 час 7 минут) Сразу после того, как Гарри и Гермиона не смогли уничтожить крестраж и Гарри говорит "We need to keep it safe", он заглядывает в кусочек своего зеркала, и камера на короткое время видна в отражении.
(примерно на 1 минуте) Когда Гермиона появляется в фильме впервые, у неё есть газета. Фотография семьи маглов не движется, хотя она помещена в волшебной газете. Однако можно предположить, что поскольку это, по сути, семья маглов, они не делали бы для себя волшебную фотографию, и само изображение — магловская фотография, поэтому люди на нём остаются неподвижны. Видно, что заглавная фотография, однако, двигается.
Гермиона, отвечая на вопрос Гарри, говорит, что не знает, как долго будет действовать зелье смены облика, которое они используют, чтобы проникнуть в Министерство магии. Однако она уже установила это в книге «Гарри Поттер и Тайная комната», где говорится, что зелье смены облика действует ровно один час. Дж. К. Роулинг заявила, что продолжительность действия зелья варьируется в зависимости от того, насколько хорошо оно приготовлено.
Интерьер дома Дурслей меняется. Когда Аластор «Мэд‑Ай» Муди и его группа появляются, чтобы вывезти Гарри, там бордовые обои, ковровое покрытие и тёмные шкафы. Позже, когда Пожиратель Смерти приходит в поисках Гарри, всё белое, а пол — деревянный. Сцена, о которой идёт речь, — удалённая сцена, и это не дом Дурслей, в который пришёл Яксли. Это дом Гермионы. Поскольку Гермиона не явилась в школу (и она — магглорожденная), предполагается, что она могла всё ещё находиться дома. Из‑за заклинания памяти её родители собрали вещи и уехали.
После уничтожения медальона Рон говорит: «Осталось всего три». Однако это якобы неверно, поскольку к тому моменту ими были уничтожены только три крестража — медальон, кольцо и дневник, и в предыдущем фильме ясно сказано, что Волдеморт/Том Марволо Риддл собирался создать семь частей души, то есть должно было остаться найти и уничтожить четыре. Волдеморт разделил свою душу на 7 частей, что означает: 6 частей находились в крестражах, а 7-я — в теле Волдеморта, так что Рон прав.
Волдеморт помещает Нагини в Годрикс Холлоу, замаскировав её под Бэтильду Бэгшот, чтобы дождаться визита Гарри. Однако у него нет никакой возможности узнать, что Гарри нуждается в Бэтильде, поскольку на этом этапе он не знает о поиске крестражей. Тем не менее Волдеморт предвидел, что Гарри отправится в Годрикс Холлоу, поскольку именно там находятся могилы его родителей.
Нагини — питон. Когда Волдеморт позволяет ей съесть человека (преподавательницу Чарити Бербидж), полное переваривание заняло бы три недели. В следующей сцене со змеёй, которая происходит через неделю после поедания, нет никаких признаков того, что она съела целого человека.
Когда Гарри, Рон и Гермиона были замечены ловцами после того, как они аппарировались из дома Лавгудов, почему они побежали, вместо того чтобы взяться за руки и аппарироваться в другое место?
В «Сказке о трёх братьях» говорится, что первый брат просит могущественную волшебную палочку. Он убивает волшебника, над которым хотел отомстить. Той же ночью другой волшебник крадёт палочку и пронзает первого брата. Это создаёт проблему, потому что палочка не была завоёвана в дуэли. Она никогда не стала бы палочкой другого волшебника, включая Альбуса Дамблдора или Гарри Поттера. Согласно «Законам верности волшебной палочки».
Когда двойники Гарри и их спутники прибывают в Нору, Люпин проверяет Гарри, чтобы убедиться, что он настоящий. Когда начинают прибывать остальные, Кингсли Шеклбот проверяет Люпина, но Люпин не проверяет его в ответ. Никого больше не проверяют.
Очевидно, что в отдельных сценах фильма у очков Гарри отсутствуют линзы.
Когда Фред и Джордж появляются в Норе после того, как за ними гнались Пожиратели смерти, их более короткая одежда "Гарри" всё ещё им подходит.
(примерно на отметке 1:30) Когда Гермиона читает книгу Риты Скитер, она сообщает Гарри, что обнаружила: мальчик на фотографии в доме Батильды Бэгшот — это Геллерт Грин-де-Вальд. Когда она вручает Гарри книгу, если присмотреться, можно увидеть овальное отверстие на передней обложке там, где должно быть движущееся изображение Дамблдора.
