Во 2 сезоне сериала «Амнезия» с Эмили Бирн сняты все обвинения. Ей предлагают вернуться на службу в ФБР. Для героини по-прежнему главным делом жизни остаются поиски того, кто ее похитил. Пока Эмили совместно с полицией ведет расследование, в городе случается череда убийств, совершенных при помощи сильнодействующего наркотика. Эмили выходит на след международной преступной организации наркоторговцев. Наркотик как-то связан с похищением Эмили и применялся в ходе жестоких экспериментов таинственного доктора.