С этой змеей связано множество невероятных мифов и суеверий. Но героям фильма предстоит убедиться в том, что змеи-мутанты продолжают размножаться, истребляя непрошенных «гостей», проникших в Царство Анаконды. Всполошенные рядом научных и корыстных экспедиций, гигантские рептилии начинают собственную охоту. Правда, это не останавливает желающих нажиться на сулящем большую прибыль трофее. Обычно новый сезон дождей выводит змею из оцепенения…
Действие происходит сразу после окончания предыдущего фильма. Герпетолог Аманда Хейс наконец узнает истинное лицо своего работодателя Мердока, когда он нанимает врача для сбора свежего запаса кровяных орхидей, чтобы поэкспериментировать с регенерирующим нектаром на детеныше змеи, чтобы найти лечение для своей собственной неизлечимой болезни. Аманда вынуждена тайно собрать еще одну команду ученых, которые сразятся с хорошо вооруженным отрядом людей Мердока, чтобы украсть желанные орхидеи, прежде чем убийца-анаконда выследит их обоих…